免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)实验
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)实验流程:
样品准备
将不同分组的细胞从培养箱中取出(每组2个10cm的皿),在冰上用预冷的PBS洗一遍,加入裂解液(20mM Tris-HCL Ph7.5、150 mM Nacl、1%TritonX-100、1 mM EDTA和蛋白酶抑制剂),用细胞刮裂解细胞。13000rpm 4℃离心10min,去上清进行蛋白定量。定量后原液备用。
蛋白定量
1 标准曲线的绘制:取一块酶标板,按照下表加入试剂
孔号 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
蛋白标准液(μl) | 0 | 2 | 4 | 6 | 8 | 12 | 16 | 20 |
去离子水(μl) | 20 | 18 | 16 | 14 | 12 | 8 | 4 | 0 |
蛋白浓度(μg/μl) | 0 | 0.05 | 0.1 | 0.15 | 0.2 | 0.3 | 0.4 | 0.5 |
2. 根据样品数量,将BCA试剂A与试剂B按体积比为50:1配制适量BCA工作液,充分混匀;
3. 各孔加入160μl BCA工作液;
4. 把酶标板放在振荡器上振荡30sec,37℃放置30分钟,然后在562nm下测定吸光度。以吸光值为横坐标,蛋白浓度(μg/μl)为纵坐标,绘出标准曲线;
5. 在酶标板中加入2μl待测蛋白和18μl PBS(稀释10倍),加入160μl BCA工作液,把酶标板放在振荡器上振荡30sec,37℃放置30分钟,然后在562nm下测定吸光度。
6. 根据所测样品的吸光值,在标准曲线上即可查得相应的蛋白浓度(μg/μl),乘以样品稀释倍数(10)即为样品实际浓度(单位:μg /μl)。
共沉淀
根据蛋白定量结果,将各组蛋白留取适量用于做input对照;
分别取各组细胞蛋白置于2个1.5ml离心管中(2mg每管),其中一个加入2ug IgG,另外一个加入2ug IP指标对应的抗体,冰上孵育2h;
分别向两个管子中加入protein G-Agarose beads(Roche),加裂解液至1ml。4℃旋转混匀,孵育过夜;
2500rpm,4℃离心1min,去上清,1ml裂解液洗涤沉淀4次;
加入2×蛋白上样缓冲液,轻轻混匀后煮沸5min,2500rpm离心1min,弃沉淀;
将上清转移至新的离心管中,用于western blot检测相应蛋白。
PAGE胶的制备
1. 下层分离胶的制备
根据目的蛋白的分子量选择不同的凝胶浓度,高分子量蛋白用低浓度胶,低分子量蛋白用高浓度胶分离。 GRα 90kDa AP-1 43.48kDa IkB 39kDa STAT3 79, 86kDa NF-KB p65 故选用10%的胶。不同浓度的分离胶按下表进行配制,待下层胶凝固后进行上次浓缩胶的配制。
2. 上层浓缩胶的配制
根据需要按下表配制浓缩胶,并插好梳子。
上样及电泳
1. 上样
每孔上样量约为20ul蛋白,可以根据实验要求加大上样量。将配制好的PAGE胶放入电泳槽中,加入适量电泳缓冲液,取下梳子用枪轻轻吹打加样孔,避免孔内有余胶残留影响上样。将准备好的样品用加样枪慢慢加到对应的孔内,注意勿溢出加样孔。
2. 电泳
一般浓缩胶80V 20分钟,分离胶120V 60分钟,可以根据具体实验要求调整电压和时间。当染料到达胶底部时切断电源,停止电泳,进行下一步转膜。
转膜
转膜分为湿转和半干转,本实验室选用半干转。
半干式转膜中,三明治的排列为:/虑纸/胶/膜/虑纸,用电转缓冲液浸湿后,直接置于电转仪的正负极之间。胶于负极而膜置于正极。半干式的电转缓冲液不同于湿式的电转缓冲液,推荐为:48 mM Tris, 39 mM glycine, 0.04% SDS, 20%甲醇。25V转膜30分钟即可。转膜前将PVDF膜在甲醇中浸泡1-2 分钟(NC膜在电转液中浸泡10-20分钟),再孵育于冰冷的电转缓冲液中5 分钟,胶也需在冰冷的电转缓冲液中平衡3-5 分钟,否则转膜时会导致条带变形。
膜上蛋白的检测
为检测转膜是否成功,可用丽春红染色,丽春红染色工作液:2%的丽春红贮备液1:10 稀释,即加9 倍的ddH2O
染色方法:将膜放入TBST 洗一次,再置于丽春红染色工作液中,在室温下摇动染色5 分钟,大量的水洗膜直至水变清无色蛋白条带清晰,(膜也可以用TBST 或水重新洗后再进行染色)PVDF 膜需用甲醇再活化后用TBST洗后进行封闭。
膜的封闭及抗体孵育
1. 封闭:5%脱脂奶粉(检测磷酸化蛋白用BSA)室温封闭1小时或4℃过夜。
2. 一抗:根据说明书GRα 1:800 AP-1 1:1000 IkB 1:1000 STAT3 1:1000 NF-KB 1:1000 稀释抗体,抗体加入封闭液中稀释到所需浓度,和膜室温孵育2小时或4 ℃孵育过夜。
3. 二抗:孵育一抗的膜用TBST洗涤3次,每次5min。随后根据用量,按照1:1000稀释HRP标记的二抗,与膜37℃孵育1h。用TBST洗涤3次,每次5min。
显色
ECL化学发光检测:配制ECL发光液,根据用量,取ECL发光液A和B等量混匀,加在膜的正面暗室避光5分钟。倒掉显色液,用纸小心吸取显色液,在上面盖上一层平整的透明纸。将其放入成像系统中进行扫描。可以根据条带强弱再次感光或减短感光时间已达到理想结果。