空间代谢组技术服务
一、核心价值:为什么是空间代谢组?
传统 Bulk 代谢组:组织匀浆→混合提取→平均化结果,丢失空间异质性(如肿瘤边缘 vs 中心、坏死区 vs 增殖区)。
单细胞代谢组:解离成单细胞→测代谢,但破坏原位结构,丢失细胞微环境与代谢互作。
空间代谢组:完整组织切片原位扫描,一张图同时获得:
是什么:代谢物 / 药物分子身份;
有多少:相对定量(pg 级灵敏度);
在哪里:微米级空间坐标(可与 HE / 免疫荧光配准)。 直观呈现 “代谢微区",如肿瘤高代谢灶、免疫细胞代谢热点、药物富集位点。
二、主流技术(MSI 质谱成像三JU头 + 新型平台)
1)MALDI-MSI(基质辅助激光解吸电离,最主流)
原理:切片涂基质→激光逐点扫描→分子电离→质谱检测→生成二维分布热图。
分辨率:5–50 μm(近单细胞);覆盖:500–2000 种代谢物 / 脂质。
优点:灵敏度高、定量稳、适配冷冻 / FFPE;适合肿瘤、神经组织、药物分布。
2)DESI-MSI(解吸电喷雾电离,常压、无需基质)
原理:带电溶剂液滴喷射切片表面→萃取并电离分子→质谱检测。
分辨率:20–100 μm;覆盖:中高极性代谢物、药物。
优点:前处理极简、常压操作、不破坏组织;适合新鲜 / 冷冻组织、活体成像。
3)SIMS(二次离子质谱,超高分辨率)
分辨率:1–5 μm(亚细胞);覆盖:小分子、元素、脂质。
优点:无基质、超高分辨、可测元素;缺点:覆盖低、定量差、仪器昂贵。
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4)AFADESI-MSI(气流辅助 DESI,国产高灵敏平台)
在 DESI 基础上加气流辅助,灵敏度提升 10–100 倍,可测低丰度神经递质、激素。
搭配 Orbitrap,高质量精度、可精准鉴定代谢物。
三、实验流程(以 MALDI-MSI 为例,5 步出图)
1. 样本制备:新鲜组织→速冻→5–10 μm 冰冻切片(FFPE 需脱蜡)。
2. 基质喷涂:均匀喷基质(如 DHB),形成共结晶。
3. 质谱扫描:激光按网格逐点轰击→每个像素采集一张质谱图。
4. 数据处理:峰提取→代谢物鉴定(数据库匹配)→空间热图生成(与 HE 染色叠加)。
5. 多组学整合:与空间转录组 / 蛋白组配准,构建 “基因 - 蛋白 - 代谢物" 空间调控网络。
四、核心应用场景
1)肿瘤研究(最热)代谢异质性:区分肿瘤中心(高糖酵解)、边缘(高脂质)、坏死区(低代谢)。
边界精准判定:手术切缘代谢标志物,指导精准切除。
免疫微环境:T 细胞 / 巨噬细胞代谢(如乳酸、ATP)空间分布,解析免疫抑制机制。
耐药靶点:耐药亚群te有代谢物(如谷胱gan肽),指导代谢靶向药。
2)药物研发(从分子到体内)
原位分布:小分子药物 / 抗体偶联药物(ADC)在肿瘤、器官的富集位点。
药代动力学:吸收、分布、代谢、排泄(ADME)的空间动态。
药效评价:药物诱导的代谢重编程(如凋亡、氧化应激)空间可视化。
3)神经科学
脑代谢图谱:神经元、胶质细胞、突触的代谢物(如谷an酸、GABA)分布。
疾病机制:阿尔茨海默病(Aβ 斑块周边高氧化脂质)、帕金森病(路易小体代谢特征)。
4)发育与疾病机制
胚胎发育:器官发生的代谢轨迹(如心脏、肝脏分化)。
代谢疾病:糖尿病视网膜病变(玻璃体 / 脉络膜代谢异常)、脂肪肝(脂滴分布)。
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